乐发科研起始于1993年设立的东亚种子研发中心，下设13个育种所，涵盖玉米、水稻、高粱、大豆、向日葵、蔬菜、马铃薯、林果等，试验站和测试中心遍布全国。
拥有科技骨干约60人，包括多位业界知名博士和科学家；
与中国农业大学、中国农业科学院、辽宁省农业科学院、沈阳农业大学等密切合作；
与科沃斯、拜耳、先正达、杜邦等广泛合作交流；
至今累计研发投入约4.5亿元；
95%以上的品种为自主研发，并拥有独立知识产权；
主要研发机构包括：东亚现代种业研发中心（沈阳沈北新区，60亩）、乐发国际种子研发中心（沈阳清水台，1800亩）、乐发海南繁育基地（三亚凤凰镇，80亩）、北美乐发研发中心（加拿大安大略省，630亩）

东亚现代种业研发中心由清华大学建筑设计研究院规划设计，建有1.2万平方米的综合研发楼和1000平方米的人工气候室，配置仪器设备约400台（套），投入经费近2亿元。研发中心设有玉米生物育种国家重点实验室、农业农村部东北主要作物遗传育种重点实验室，划分为六大功能平台，不但可以提供植物基因组服务，也可在人类和动物基因组方面提供高通量DNA提取、SSR/KASP检测、芯片检测和精准医疗等服务。

乐发践行科企合作模式，与中国农业大学国家玉米改良中心、北京市农林科学院国家信息研究中心和玉米研究中心、沈阳农业大学、中科院沈阳自动化研究所等重点高校和科研院所强强合作，取得多项重要专利性成果。

自2006年参与国家火炬计划至今，乐发承担了农业农村部、科技部、发改委和省市各级政府部门的系列科研任务百余项，包括多个国家转基因重大专项和技术攻关。